科研团队 科研团队

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        代谢物组学团队目前有工作人员20名,在读研究生7名,其中博士研究生4名,硕士研究生3名。已毕业博士研究生11名,硕士研究生14名(7名本所和7名联合培养)。

工作人员

   崔球 博士,研究员,团队负责人

   丁筱珂 硕士,团队秘书

   冯银刚 博士,研究员

   肖艳 博士,副研究员

   宋晓金 博士,副研究员

   刘亚君 博士,副研究员

   东升 博士,副研究员

   陈超 博士,助理研究员

   王森 博士,助理研究员

   张慧丹 博士,博士后

   刘纪阳 学士,技术员

   封雪梅 学士,技术员

   周晓峰 硕士,工程师

   杨杰 博士,博士后

   万伟建 硕士,科研助理

   马豪,技术员

   李华坤,技术员

   刘欢 博士,助理研究员

   刘博洋 硕士,科研助理

   田晓荣 硕士,科研助理

硕博在读

桃李天下

冯银刚 冯银刚

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冯银刚,博士,研究员,博士生导师 [ResearcherID] [ResearchGate] [ORCID]

1999年毕业于南京大学物理学系生物物理专业,获理学学士学位,2004年毕业于中国科学院生物物理研究所生物化学与分子生物学专业,获理学博士学位,2004-2006在北京大学化学与分子工程学院北京核磁共振中心进行博士后研究工作,2006-2011年在中国科学院生物物理研究所任副研究员,2011年6月在中国科学院青岛生物能源与过程研究所任研究员。2016年9月至2017年9月在美国耶鲁大学分子生物物理与生物化学系(Thomas A. Steitz实验室)做访问学者研究。长期从事能源微生物蛋白质、癌症相关蛋白质、古菌蛋白质等的结构、功能、调控和蛋白质工程研究,目前主要通过生物物理、生物化学、遗传改造和代谢工程等技术解析木质纤维素生物质高效转化机制和工业酶催化机制。在Proc. Natl. Acad. Sci. USANucleic Acids Res.J. Biol. Chem.等国际SCI刊物发表90余篇研究论文。任中国生物物理学会生物磁共振专业委员会委员。承担过国家自然科学基金,863计划,北京市自然科学基金等多项研究项目。

研究领域

1.微生物对木质纤维素的高效降解机制及其在生物质资源转化中的应用。主要研究对象包括纤维小体、转录调控因子、关键代谢酶与转运蛋白等。

2.工业微生物中重要酶和调控蛋白的催化机制与蛋白质工程。主要研究对象包括纤维素酶、环氧化物水解酶、P450酶、聚酮合酶等。

教育和学术经历

1995年9月- 1999年6月    南京大学物理学系,学士

1999年9月- 2004年6月    中国科学院生物物理研究所,博士

2004年7月- 2006年6月    北京大学化学与分子工程学院,北京核磁共振中心,博士后

2006年6月-2011年5月     中国科学院生物物理研究所,副研究员

2011年6月至今                 中国科学院青岛生物能源与过程研究所,研究员

2016年9月-2017年9月    美国耶鲁大学,分子生物物理与生物化学系(Thomas A. Steitz实验室),访问学者

主持基金项目

2017-2020 国家自然科学基金:梭菌纤维小体调控因子信号传导的结构与分子机制的核磁共振研究

2017-2019国家自然科学基金(中以国际合作):溶纤维假拟杆菌生物质传感巨型调控元的机制解析

2013-2016 国家自然科学基金:梭菌的纤维小体组装模块的结构、相互作用与理性设计的核磁共振研究

2012-2015 国家高技术研究发展计划(863计划):光能人工细胞工厂的构建及应用——产物合成元件与模块的高效筛选、分离、鉴定与设计制造——产物合成元件的蛋白质工程与工程微藻细胞的代谢组学研究

2012-2015 国家自然科学基金:结核分枝杆菌药物靶标蛋白NrdH 氧还酶结构与相互作用的核磁共振研究

2010-2012 国家自然科学基金:肿瘤抑制相关蛋白RBBP1的结构与相互作用的核磁共振研究

2009-2011 国家自然科学基金:翻译控制的肿瘤蛋白与信号通路蛋白质相互作用的核磁共振研究

2009-2011 北京市自然科学基金:翻译控制的肿瘤蛋白与其他信号蛋白质的相互作用

2004-2006 中国博士后科学基金:对杨树的谷氧还蛋白Grx1的结构和功能的核磁共振研究

 

代表性研究论文(更多论文请访问:[英文页面] [PubMed] [GoogleScholar] [ResearcherID] [ResearchGate] [ORCID])

1.      Zhen Wei, Chao Chen, Ya-Jun Liu, Sheng Dong, Jie Li, Kuan Qi, Shiyue Liu, Xiaoke Ding, Lizett Ortiz de Ora, Iván Muñoz-Gutiérrez, Yifei Li, Hongwei Yao, Raphael Lamed, Edward A. Bayer, Qiu Cui, Yingang Feng* (2019) Alternative σI/anti-σI factors represent a unique form of bacterial σ/anti-σ complex. Nucleic Acids Res. 47(11):5988-5997.
https://doi.org/10.1093/nar/gkz355

2.      Ya-Jun Liu, Kuan Qi, Jie Zhang, Chao Chen, Qiu Cui*, Yingang Feng* (2018) Firmicutes-enriched IS1447 represents a group of IS3-family insertion sequences exhibiting unique +1 transcriptional slippage. Biotechnol. Biofuels 11:300.
https://doi.org/10.1186/s13068-018-1304-8

3.      Sheng Dong, Xi Liu, Gu-Zhen Cui, Qiu Cui*, Xinquan Wang*, Yingang Feng* (2018) Structural insight into the catalytic mechanism of a cis-epoxysuccinate hydrolase producing enantiomerically pure D(-)-tartaric acid. Chem. Commun. 54(61):8482-8485.
https://doi.org/10.1039/C8CC04398A

4.      Ya-Jun Liu†*, Shiyue Liu†, Sheng Dong, Renmin Li, Yingang Feng*, and Qiu Cui* (2018) Determination of the native features of the exoglucanase Cel48S from Clostridium thermocellum. Biotechnol. Biofuels 11, 6.
http://dx.doi.org/10.1186/s13068-017-1009-4

5.      Lei Du†, Sheng Dong†, Xingwang Zhang, Chengying Jiang, Jingfei Chen, Lishan Yao, Xiao Wang, Xiaobo Wan, Xi Liu, Xinquan Wang, Shaohua Huang, Qiu Cui, Yingang Feng*, Shuang-Jiang Liu*, and Shengying Li* (2017) Selective oxidation of aliphatic C-H bonds in alkylphenols by a chemomimetic biocatalytic system. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 114(26), E5129-E5137.
http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1702317114

6.      Chao Chen, Zhenling Cui, Xiangfei Song, Ya-Jun Liu, Qiu Cui*, and Yingang Feng* (2016) Integration of bacterial expansin-like proteins into cellulosome promotes the cellulose degradation. Appl. Microbiol. Biotechnol. 100(5), 2203-2212.
http://dx.doi.org/10.1007/s00253-015-7071-6

7.      Huiwen Wu, Weibin Gong, Xingzhe Yao, Jinfeng Wang, Sarah Perrett* and Yingang Feng* (2015) Evolutionarily conserved binding of translationally-controlled tumor protein to eukaryotic elongation factor 1B. J. Biol. Chem. 290(14), 8694-8710.
http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M114.628594

8.      Chao Chen, Zhenling Cui, Yan Xiao, Qiu Cui, Steven P. Smith, Raphael Lamed, Edward A. Bayer and Yingang Feng* (2014) Revisiting the NMR solution structure of the Cel48S type-I dockerin module from Clostridium thermocellum reveals a cohesin-primed conformation. J. Struct. Biol.188(2), 188-193.
http://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2014.09.006

9.      Weibin Gong, Jinfeng Wang, Sarah Perrett* and Yingang Feng* (2014) Retinoblastoma-binding protein 1 has an interdigitated double Tudor domain with DNA-binding activity. J. Biol. Chem. 289(8), 4882-4895.
http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M113.501940

10.  Xi Liu, Shian Liu, Yingang Feng*, Jian-Zhong Liu, Yuling Chen, Khanh Pham, Haiteng Deng, Kendal D. Hirschi, Xinquan Wang*, and Ninghui Cheng* (2013) Structural insights into the N-terminal GIY-YIG endonuclease activity of Arabidopsis glutaredoxin AtGRXS16 in chloroplasts. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 110(23), 9565-9570.
http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1306899110

授权专利

1.      一种裂殖壶菌及利用其高密度发酵生产DHA油脂的方法;专利号201210251850.X;崔球,高莽,宋晓金,冯银刚;2014.12.10授权

2.      富含n-3多不饱和脂肪酸的佐餐酱及其制备方法;专利号201410632170.1;崔球,宋晓金,谭延振,冯银刚;2016.03.02授权

3.      一种裂殖壶菌及其应用;专利号2014102030410;崔球,宋晓金,谭延振,冯银刚;2016.03.30授权

4.      产多不饱和脂肪酸的高山被孢霉及其应用;专利号201410222240.6;崔球,谭延振,宋晓金,冯银刚;2016.06.01授权

5.      一种快速测定含油微生物胞内多不饱和脂肪酸含量的方法;专利号201410118153.6;冯银刚,兰君,谭延振,宋晓金,崔球;2017.09.26授权

6.      一种适用于嗜热微生物遗传改造的基因元件及其载体和应用;专利号201410155715.4;崔球,洪伟,Georg Mohr(乔治·莫尔),Alan M. Lambowitz(艾伦·莱伯维兹) ,刘亚君,冯银刚;2018.10.09授权

7.      一种高产角鲨烯的类酵母菌及其应用;专利号201410829522.2;崔球,宋晓金,谭延振,王晓龙,冯银刚,李文利;2018.10.09授权

8.      一种寇氏隐甲藻及其应用;专利号201610547947.3;崔球,宋晓金,马增新,崔古贞,冯银刚;2019.7.26授权